黄珍吾是海南文昌人，属于热血归国华侨。他早年间曾在南洋当了一阵子中学校长。教书育人必须以身作则为人师表，所以黄珍吾是比较正直的人。军阀混战，国家处于动乱之中，黄珍吾回国参与建设，进入粤军部队中，黄埔军校正式成立后，黄珍吾进入第一期学习，虽然黄珍吾很喜欢拿枪上战场，但以他爱较真的性格，得到大伙的信任，上司分给他的工作多是军需长、宪兵长官一类需要不贪不黑的职务。所以尽管他和胡宗南、陈赓等人是同学，上阵打仗的机会并不多，抗战时期多半在敌后组织游击活动，连四期的戴子奇都早于他当师长。

黄埔一期生里有好些犟牛，好认死理。黄埔一期生多以骨头硬、身先士卒、为人正直一根筋闻名于世，黄珍吾绝对算一个。蒋介石为此也深感苦恼，虽然他也爱才，但办实事时，不会变通的反作用力也很大。1931年6月，已经是宪兵团长的黄珍吾遇到了人生的一道坎，一位名叫韬朋的英国间谍计划走私一批军火，刚走到昆山火车站外，刚好有几名宪兵正在火车站附近查哨，见这个英国人形迹可疑，便问其口令，结果英国人韬朋做贼心虚拔出手枪，当场打死了2名宪兵逃之夭夭。宪兵营出动部队进行搜捕，最终抓住了英国间谍韬朋。押送到了团部，宪兵团长黄珍吾亲自对其进行审问，面对黄珍吾的审问，韬朋仗着自己的英国人身份一点儿也不紧张，他知道官越大越不敢把他怎样，因此傲慢翘起二郎腿抖了起来。

黄珍吾不惯这臭毛病，一脚踢了过去，英国人稍稍老实了点。黄珍吾也明白“弱国无外交”的道理，而且法律也制裁不了韬朋，最后只能将韬朋关了起来。但韬朋的手上还有两条人命，在中国的土地上枪杀宪兵，能让这些外国人横行吗？黄珍吾于是悄悄找了几个信得过的人，在一个夜晚将韬朋秘密处决。然而，没有不透风的墙，英国间谍机构也收到了韬朋被国军宪兵团逮捕的消息。于是英国领事馆开始向国民党方面施压，要求彻查韬朋一事。蒋介石迫于压力，下令国民党江苏省政府跟进追查，虽然黄珍吾等人遮盖得很严，但是还是有一位属下说漏了嘴。为了平息英国方面的怒气，最终黄珍吾被军法处逮捕，并判处黄珍吾有期徒刑十四年。

黄埔一期学生的性格，蒋介石还是很清楚的，这些学生因为耿直常常带来一些麻烦。当时蒋介石用十六个字评价黄珍吾：“性格浮躁，蛮横跋扈，非经磨砺，不可出山。”秘书接话道 ：“明明可以用一百种方法收拾这个英国人，偏偏用一个最差的”。长官送黄珍吾进监狱时，也连连摇头：“鬼迷心窍，鬼迷心窍。”但是黄珍吾实际上只坐了二年牢，1933年，黄珍吾便假释出狱。黄珍吾被蒋介石安排在侍从室当上校参谋，原本黄珍吾以为一辈子就这样了，平静的心再难有浪潮。命运的安排也好，捉弄也好。黄珍吾因祸得福，他的事情早就被时任青年军政治部主任的蒋经国，看在眼里记在心上了，他就需要这种有担当的人。

蒋经国一直努力培植自己势力，和蒋介石一样，也以黄埔嫡系为骨干，他选上的人更是鸡蛋里的骨头。太子以抗战为由，任命黄珍吾为青年军208师师长。不久后，他又被提拔为副军长。再后来黄珍吾又被蒋经国调到广州行辕担任政治部主任。抗战胜利以后，军队缩编造成大批军官被裁减，主力军都被整编为师。裁减力度非常大，二线军官分流到警察系统，当时颁布的《复员军官转任警察人员任用办法》规定：少将以上军官者经警官补习教育后任用为简任警官。在蒋经国的安排下，黄珍吾担任首都警察厅中将厅长，掌管南京治安。

但是在战争期间，军权远高于警权，黄埔一期的黄珍吾简任一级警官，顶着陆军中将衔，也算位高权重了。然而就地位来说，就未必比第74军军长张灵甫高，尽管后者的铨叙军衔仅仅是陆军少将，但是人家兼着“南京警备司令”。非常时期，仗打输了政权都将不复存在，所以军队享有特殊地位也就不奇怪了。蒋经国跟前的红人和蒋介石跟前的红人相比，多少还是要差些的。1949年，国民党在大陆的政权风雨飘摇，黄珍吾一路随国民党军败退到了台湾，由于他是“太子系”的骨干，到台湾后仍然得到蒋介石的重用，先后担任国民党宪兵司令、台北卫戍司令官、总统府中将参军等职。于1962年退役，此后还当过中央执行委员。1969年，黄珍吾因病去世，享年68岁。